El 90% de la ciudad de Jesús María está cubierta por la red de cloacas. Este sistema se encuentra disponible desde 1990.

Los efluentes generados van a la planta de tratamiento ubicada a 3 km al este de la ciudad.

La planta consiste en 3 módulos de 2 lagunas cada uno; la primer laguna cumple la función anaeróbica, y la segunda laguna una función aeróbica.

En esta planta se realizan mantenimiento y controles diarios. Los mantenimiento tienen que ver con el control de malezas, limpieza de los canales de entrada, reparación de bombas de cloro y desbarrado de las lagunas; los controles se refieren a análisis de D.B.O., detergente, Ph, sulfuros, bacteriológicos, y otros que tienen que ver con el comportamiento microbiológico de las lagunas.

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